系列短篇小说500篇是由시즈카执导，奥村望,西藤尚,爱染恭子,费米·本纽西主演的一部科幻片。主要讲述了：利用步美找到的暗号解读表，柯南本以为能顺利解开暗号，不料却遇到了瓶颈。正当此时，若狭老师再次拜托少年侦探团前往旧仓库寻找石灰。来到旧仓库的众人发现仓库一片狼藉，在若狭老师不经意的提示下，柯南终于解开了暗号的含义，并推测犯人将再次来到旧仓库。为了避免打草惊蛇，柯南设计误导犯人，并在深夜与若狭老师等人再次来到旧仓库，柯南能否顺利将犯人一网打尽？半年前毛利小五郎去杯户北町工作时，碰巧遇到了一起事件。名为桐崎礼美的女性被发现吊死在自己的公寓中，因为房东和桐崎的邻居惠小姐都能证明她有自杀的倾向，外加她还留有一封遗书，所以事件被当做自杀处理。桐崎的死让惠小姐非常自责，而小五郎的话让她重新振作了起来，为了感谢小五郎才有了今天的约会，但在约会中柯南却看出那起案件的隐情。